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vector nti advance 11

v11.5.4 免費版 vector nti advance 11 網友評分:8

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軟件介紹

軟件標簽: vectornti 行業軟件

vector nti 11.5是一款在生物行業中廣泛運用的工具,為你帶來最便捷的生物分析分析工,輕松的對各類生物元素進行最全面最細致的分析,同時能夠得到點陣關系圖,快速進行基因匹配等功能,快來綠色資源網下載吧!

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vector nti advance在序列對比、蛋白質研究、基因分析等方面也是可以使用的,為生物學研究人士提供一個可以計算的實驗平臺。在生物數據分析上的使用是非常廣泛的,其提供的四個分析模塊可以針對DNA、限制酶、引物分析、蛋白質等類型的生物數據進行詳細模擬和演化分析,您可以將自己的實驗數據加載到軟件中,創建一個可以持續分析的實驗模擬過程,在不同的實驗階段輸入得到的數據,通過掌控數據參數的方式讓分子不斷進化,從而對未來的生物數據進行預測和判斷分析;

vector nti 11軟件特色

從AlignX出口分子

在文本窗格中選定的分子可以出口到GenBank、EMBL(GenPept蛋白質)(SWISS-PROT蛋白質),或為原序列fasta文件。若要將分子導出到外部文件,請選擇項目>導出分子,并在“文件保存”對話框中選擇文件類型。

得分矩陣-- AlignX

設計成對序列比對評估的所有算法都是基于將分數分配給對齊殘基的系統,檢測不同序列之間的相似性。眾所周知,某些氨基酸在其他相關蛋白質中很容易被其他氨基酸取代,這可能是因為它們具有相似的理化性質。根據氨基酸被替換為原始殘基的相似性,這些“替換”被分配在矩陣中顯示的分數。在對齊分數上相同或相似的殘留物比那些不太相似的殘留物高

比對pcr分析報告

當搜索完成時,如果您在結果選項卡上檢查了生成報告選項,則對齊PCR報告預覽窗口顯示分析結果。比對PCR分析報告對話框的外觀和功能類似于多重PCR分析報告對話框。

關于點陣

點陣分析主要是比較兩個序列來尋找所有可能的殘基匹配的方法。該方法還可用于蛋白質和DNA序列中的直接或反向重復序列。它可以預測RNA中自我互補的區域,從而形成雙鏈區或二級結構。

分析bioannotator

bioannotator是一套全面的蛋白質和核酸序列分析工具,超過五十種不同的預定義的蛋白表與特征映射和序列提供。bioannotator還提供以下先進的搜索和分析工具,它是運行在分析監控:PROSITE,Pfam,塊和蛋白水解裂解。

通過Web執行分析

Vector NTI使得它很容易把你的alignx數據直接到公共網站已經建立了一個分子的三維結構,比較它與其他分子,特定功能的搜索,或進行基因預測,等等。

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分析GenomBench

genombench是Vector NTI提前的基因組項目的主力。genombench可以容納一個堿基的基因組片段,可以檢索從兼容的系統兼容的服務器上的數據,例如UCSC和Ensembl。它提供了瀏覽和查詢這些網站使用關鍵詞,界面兩側標記,BLAT(UCSC數據庫)或SSAHA(的)。genombench還提供以下先進的搜索和分析工具,它是運行在分析監控

對分子序列的操作

我們以一個DNA序列為例,進行一系列的常規分析;最后將此DNA序列翻譯成氨基酸序列,并對此氨基酸序列進行各種分析。

對齊顯示設置——Consensus Calculation Tab

一致性序列是一個理論上有代表性的核苷酸序列,其中每個核苷酸代表在同一位點上在同一位點上經常看到的殘基,或由其他標準選擇。“對齊設置”對話框中的“一致性計算”選項卡指定如何以對齊方式計算對齊窗格中作為底部序列的一致序列。

以點擊作為特征輸出查詢分子

當您導出查詢顯示為特征的分子打成。GFF文件,使用點擊功能GFF文件命令導出查詢分子保存。GFF文件到外部位置(硬盤、軟盤、網絡等)。你可以打開一個。在一個Vector NTI分子視窗GFF文件并將其保存到Vector NTI數據庫,如果需要的話。。GFF文件提供一個共享查詢爆破方法打信息與其他Vector NTI用戶分子格式。

模擬電泳

模擬電泳是指對DNA片段進行酶切分析后,通過電腦模擬電泳過程,將酶切片段分離。該功能有利于評估電泳時間,便于驗證實際電泳結果的好壞。

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使用說明

圖案設置

選中“圖案”復選框,在“顯示設置”對話框中激活“圖案設置”按鈕,打開控制圖標顯示的“圖形設置”對話框。此對話框中可用的選項根據打開盒子的源分子類型而有所不同。

示設置功能

在顯示設置對話框,檢查個復選框,按框設置”按鈕來指定如何開放閱讀框ORF顯示打開設置對話框。

·檢查嵌套框復選框查找嵌套ORFs(具有相同的終止密碼子,但不同的起始密碼子,ORF)

·在起始密碼子和終止密碼子字段,輸入起始密碼子和終止密碼子為新觀眾的ORFs。按默認的啟動和停止按鈕來設置起始密碼子和終止密碼子的傳統價值觀:起始密碼子ATG、GTG;終止密碼子TAA,TGA,標簽。

·在最小ORF大小字段中,輸入密碼子中最小的ORF大小。

工具管理器

要打開工具管理器,請單擊工具>工具管理器。

有關使用工具管理器的信息,請按F1命令從該對話框打開聯機幫助。

工具管理器是一個Vector NTI回顧描述目前注冊工具或創建新的工具或鏈接工具和現有的工具進行現有業務信息輔助應用。

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